Hilfe:Jmol-Erweiterung

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Das Java-Program Jmol dient der Anzeige von 3D-Molekül-Strukturen. Die Bilder können in einem externen-Fenster oder in die Wiki-Seite eingebettet angezeigt werden.

Inhaltsverzeichnis

Dateien

Programme zum Erstellen von Molekül-Dateien

Jmol kann auch auf dem heimischen rechner installiert werden. Es bietet auch die Möglichkeit ein Molekül zu erstellen oder verändern, aber innerhalb von Jmol lässt es sich nicht in einer Art abspeichern, in der das Bild dynamisch angezeigt werden kann. Lediglich das Exportieren als statisches Bild (png, jpeg, ...) ist möglich.

Man braucht deshalb andere Programme um eine Datei zu erzeugen, die man dann im Wiki hochlädt und mit Hilfe der Jmol-Erwiterung anzeigt. Mögliche Programme sind:

  • Avogadro (Windows, Linux, ...)
  • ...

Im Wiki sind nur Dateien vom Typ *.cml erlaubt.

ACHTUNG: Sonderzeichen und Umlaute sollten in den Namen vermieden werden, da dies zu Problemen führen kann.

Möglichkeiten zur Einbindung

Externes Fenster

Benzol.cml Benzol2.cml

Inline

Die Bidler können auch in der Wiki-Seite selber als eingebettetes Applet angezeigt werden.

Beispiel für ein eingebettes Applet:

Zu verwendender Code:

<jmol>
   <jmolApplet>
     <size>250</size>
     <uploadedFileContents>MolekuelVersuch.cml</uploadedFileContents>
   </jmolApplet>
</jmol>

Hinweis:

  • <size>250</size> legt die Größe fest. Man kann diese Zeile weg lassen, wodurch der Bereich größer angezeigt wird.
  • <uploadedFileContents>...</uploadedFileContents> hier muss der Namen der hochgeladenen Datei stehen.


Bedienung

Die Ansicht des Moleküls lässt sich mit dem Mauszeiger leicht verändern.

  • Drehen ... mit der linken Maustaste festhalten und die Maus bewegen.
  • Zoomen ... mit dem Mausrad herein- oder herauszoomen.
  • Hoch- und runterverschieben ... STRG und rechte Maustaste drücken, Maus bewegen.
  • Um die Z-Achse (schaut aus dem Bildschrim raus) drehen ... ⇧ Shift und rechte Maustaste drücken, Maus bewegen.
  • ... weitere Möglichkeiten hier.

Einstellung im Kontextmenü

Optionen

Einstellungen der Anzeige

Beim Aufruf des Applets können einige Optionen eingestellt werden, was das Aussehen des Moleküls betrifft.

Formulare zu Bedienung von Jmol

Siehe auch